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NEB限制性內(nèi)切酶介紹

 更新時(shí)間:2023-06-13 點(diǎn)擊量:3750

NEB向研究界提供限制性內(nèi)切酶超過45年, 多年來,NEB不斷努力開發(fā)出純度最高、性能無yu倫bi的酶。

NEB限制性內(nèi)切酶分為五大類別,分別是:高保真限制性內(nèi)切酶、Homing 核酸內(nèi)切酶、Nicking核酸內(nèi)切酶、表觀遺傳學(xué)分析中的限制性內(nèi)切酶、省時(shí)有效的限制性內(nèi)切酶。

1、高保真限制性內(nèi)切酶簡介

高保真限制性內(nèi)切酶是通過交換功能性氨基酸殘基,然后篩選在廣泛條件下發(fā)揮作用的最佳突變體而設(shè)計(jì)的。無論你是將消化物放置5-15分鐘還是過夜,或者使用不同量的酶,高保真限制性內(nèi)切酶都能確保你所需的性能。

2、Homing 核酸內(nèi)切酶

Homing 核酸內(nèi)切酶是雙鏈DNA酶,具有大的不對稱識別位點(diǎn)(12-40個(gè)堿基對)和通常嵌入內(nèi)含子或內(nèi)含子的編碼序列。內(nèi)含子是由前體RNA剪接而成,而內(nèi)含子則由前體蛋白質(zhì)剪接而成。歸位核酸內(nèi)切酶是使用類似于限制性核酸內(nèi)切酶的慣例命名的,其內(nèi)含子編碼的核酸內(nèi)切酶包含前綴“I-",而內(nèi)含子編碼核酸內(nèi)切酶則包含前綴“PI-"。

Homing 核酸內(nèi)切酶識別位點(diǎn)極其罕見。例如,在隨機(jī)序列的每7 x 1010個(gè)堿基對中,18個(gè)堿基對的識別序列將僅出現(xiàn)一次。這相當(dāng)于20個(gè)哺乳動物大小的基因組中只有一個(gè)位點(diǎn)。然而,與限制性內(nèi)切酶不同,歸巢性內(nèi)切酶在其識別序列內(nèi)容忍一些序列退化。也就是說,單堿基的改變并沒有消除裂解,而是在不同程度上降低了裂解的效率。結(jié)果,它們觀察到的序列特異性通常在10-12個(gè)堿基對的范圍內(nèi)。

3、Nicking核酸內(nèi)切酶

Nicking核酸內(nèi)切酶與限制性核酸內(nèi)切酶一樣使用簡單。由于6或7堿基缺口內(nèi)切酶產(chǎn)生的缺口不會使DNA片段化,因此通過將超螺旋質(zhì)粒轉(zhuǎn)化為開環(huán)來監(jiān)測它們的活性?;蛘撸梢允褂迷谙喾吹木€束上具有足夠近的缺口位置以形成雙絞線切割的基板。

4、表觀遺傳學(xué)分析中的限制性內(nèi)切酶

許多限制性內(nèi)切酶對DNA甲基化狀態(tài)敏感。當(dāng)識別位點(diǎn)中的特定堿基被修飾時(shí),裂解可能被阻斷或受損。NEB的科學(xué)家最近鑒定了MspJI(NEB#R0661)限制性內(nèi)切酶家族,該家族依賴于甲基化和羥甲基化才能發(fā)生切割。這些酶切除了約32個(gè)堿基對片段,這些片段包含一個(gè)位于中心的5-mC或5-mC修飾的殘基,可以提取并測序。由于這種表觀遺傳學(xué)修飾的已知位置,在下游分析之前不需要亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化。這些表觀遺傳學(xué)標(biāo)記驗(yàn)證的甲基化依賴性限制性內(nèi)切酶擴(kuò)大了繪制表觀遺傳學(xué)修飾的潛力,并簡化了DNA甲基化的研究。此外,它們?yōu)楦玫亓私?-羥甲基胞嘧啶在基因組中的作用提供了機(jī)會。

我們現(xiàn)有的幾種限制性內(nèi)切酶也可用于研究DNA的表觀遺傳學(xué)修飾,如識別相同序列但不同甲基化模式的DpnI(NEB#R0176)和DpnII(NEB#R0543)。McrBC也只在一條或兩條鏈上切割甲基化胞嘧啶的DNA。MspI(NEB#R0106)和Hpall(NEB#R0171)識別相同的序列(CCGG),但對不同的甲基化狀態(tài)敏感。Hpall只切割一個(gè)wanquan未修飾的位點(diǎn):胞嘧啶上的任何修飾(5-mC、5-mCo或5-ghmC)都會阻斷切割。MspI會識別并切割5-hmC和5-hmC,但不會識別和切割5-ghmc。這些酶包含在EpiMark®5-mC和5-mC分析試劑盒(NEB#E3317)中。

5、省時(shí)有效的限制性內(nèi)切酶

在NEB,酶的生產(chǎn)與限制性修飾系統(tǒng)的克隆和過表達(dá)的基礎(chǔ)研究有關(guān)。這一重點(diǎn)使我們能夠提供濃度極gao的酶,為您的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)提供更大的靈活性。

無論您是快速篩選大量克隆還是設(shè)置過夜消化,您都將受益于我們的高質(zhì)量酶。通常,限制性消化包括將1µl酶與1µg純化DNA在50µl的最終體積中孵育1小時(shí)。然而,為了加快篩選過程,請選擇一種符合時(shí)間節(jié)約標(biāo)準(zhǔn)的NEB酶。在推薦的反應(yīng)條件下,使用1µl的酶,這些酶將在5-15分鐘內(nèi)消化1µg的底物DNA,也可以安全地用于過夜消化。與其他供應(yīng)商不同,沒有特殊的配方、濃度變化或需要購買更昂貴的新酶系才能在5-15分鐘內(nèi)完成消化,也不必?fù)?dān)心孵化時(shí)間過長。

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